• Ya es posible importar los resultados de la búsqueda en PubMed a un programa como Excell mediante una nueva herramienta llamada FLink (Frequency-weighted Links) que se encuentra accessible en el NIH National Center for Biotechnology Information (NCBI): http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/flink/docs/flink_about.html .

    FLink permite salvar los resultados de PubMed como archivo CSV el cual puede importarse en un programa como Excel.

    Estos son los pasos a seguir:

    1. Introduzca la consulta que desee en PubMed.
    2. Abrir FLink ( http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/flink/flink.cgi ).
    3. Abrir el menú “Please choose a database to start” y selecciones “PubMed.”
    4. Seleccione “Input from Entrez History” del cuadro de diálogo que le permite seleccionar el método deseado de entrada.
    5. a) utilizar el menú desplegable de la pestaña para ver una lista de sus últimas búsquedas en PubMed;
      b) seleccionar la consulta en PubMed para el que desea descargar un archivo de resultados de búsqueda con formato CSV;
      c) pulse el botón “Submit”
    6. Flink ahora mostrará los resultados de su búsqueda en una pestaña de «PubMed».
    7. Seleccione la opción “Download CSV” y elija la opción abrir o guardar el archivo, según desee. (La ventana del navegador también mostrará la dirección URL en la que los resultados se puede recuperar.)
    8. Las columnas del archivo CSV dependerá de la base de datos a la que accede a través de Flink. Para PubMed, las tres columans incluirá:
      1. UID (PMID)
      2. Autores
      3. PubDate (Año)
      4. PubDate (Mes)
      5. Formato Summary del artículo (que incluye la siguiente información en una sola celda: autores, título, nombre de la revista, año, mes (si es aplicable), volumen, número, páginas)

      Traducido de: Dragonfly » Blog Archive » FLink: A New Way to Save PubMed Search Results.

  • REBIUN, R. d. B. U. E. Ciencia 2.0: Aplicaciones de la web social a la investigación. Rebiun vol., n. 2010.

    Descargar Estudio de REBIUN sobre Ciencia 2.0 y las aplicaciones de la web social para la investigación aquí.

    vía Ciencia 2.0: Aplicaciones de la web social a la investigacin.

  • El 18 de noviembre de 2010, la Biblioteca Nacional de Medicina ® (NLM ®) conmemoró el 50 aniversario del MeSH.
    El tesauro MeSH, o Medical Subject Headings, es un lenguaje artificial que utiliza un vocabulario controlado. Es el tesauro utilizado para la indización y recuperación de información en la base de datos MEDLINE. Contiene encabezamientos de materias, calificadores (subencabezamientos), definiciones, referencias cruzadas, sinónimos y listas de términos estrechamente relacionados.

    El MeSH fue publicado por primera vez en 1960 aunque las semillas fueron plantadas en diciembre de 1947. La primera edición MeSH contenía 4300 descriptores y fue diseñado para ser utilizado tanto para la indización y catalogación. La edición de 2011 contiene más de 26.000 encabezamientos de materia en una jerarquía de once niveles y ochenta y tres subencabezamientos. Cada año se revisa y actualiza para asegurar que MeSH sigue siendo útil como una forma de clasificar los conocimientos médicos y de disciplinas afines para conseguir la recuperación de la información. De esta forma el MeSH tiene 50 años pero es nuevo cada año.

    El MeSH tiene traducción al español conocida como Descriptores en Ciencias de la Salud (DeCS).

    Más información de eventos del 50 aniversario del MeSH aquí e información del MeSH aquí.

  • En breve estará disponible el nuevo subset en PubMed «dietary supplements«. Este subconjunto está diseñado para limitar los resultados de búsqueda para las citas de un amplio espectro de la literatura de suplementos dietéticos incluyendo vitaminas, minerales, fitoquímicos, ergogénicos, botánicos y suplementos de hierbas en la nutrición humana y en modelos animales.

    Este subset se añadirá como nueva opción dentro de «Subset category» que encontramos en la página de límites (Limits). También podrán ser incorporado en nuestra estrategia de búsqueda añadiendo AND dietsuppl [sb].

    Ejemplo:  diabetes AND dietsuppl [sb]

    El subset de «dietary supplements» tiene una considerable solapamiento con el subset «Complementary Medicine», pero con cada uno se obtienen registros únicos. Para limitar la recuperación a los dos subset hay que marcar ambas casillas en la categoría de subset de la página de Limits de PubMed.

    Más información en: Dietary Supplements — A New PubMed Subset. NLM Technical Bulletin. 2010 Sep–Oct.

  • El curso que ha comenzado el 13 de octubre de título “Acceso  a los recursos bibliográficos por el Hospital Universitario de Getafe y BVALE” ha sido acreditado por la Comisión de Formación Continuada de las Profesiones Sanitarias de la Comunidad de Madrid con 1 crédito.

    El curso que comenzará el 10 de noviembre de título “Recursos de Información y Documentación Científica en Ciencias de la Salud” ha sido acreditado por la Comisión de Formación Continuada de las Profesiones Sanitarias de la Comunidad de Madrid con 2,4 créditos.

  • Durante los días 13, 14 y 15 de octubre se va a celebrar en la Biblioteca del Hospital de Getafe el curso de «Acceso a los recursos bibliográficos suscritos por el Hospital de Getafe y la BVALE» de 8:30 a 10:30 horas.

    Mientras dure el curso no estarán disponibles los ordenadores de la Biblioteca.

  • Copio del Blog para reclamar acceso abierto a Internet en las consultas médicas de España el siguiente texto:

    A punto de finalizar la primera década del siglo XXI, muchas consultas médicas de nuestro país, aun disponiendo de ordenador conectado a una red informática, tienen bloqueado el acceso a Internet o éste se encuentra muy limitado… por decisión de los gestores sanitarios. Como en el absurdo caso de los diversos calendarios de vacunación españoles, las restricciones son diferentes de unas comunidades autónomas a otras, llegando a ser casi absolutas en algunas de las que se autoconsideran más avanzadas en la implantación de las nuevas tecnologías en el ámbito sanitario. [ver mapa de la situación] Resulta evidente que esta actitud de censura es precisamente una muestra de desconocimiento, tanto de la utilidad como del funcionamiento de esas nuevas (ya no tanto) tecnologías y además constituye una flagrante desconsideración hacia el médico y sus pacientes. Es de sentido común que este error se subsane cuanto antes y en consecuencia solicitamos el acceso abierto y sin restricciones a Internet desde las consultas de los profesionales sanitarios españoles para solucionar una necesidad real, tanto de ellos como de la población atendida, y que se concreta en:

    • Necesidad de INFORMACIÓN. Prácticamente todo resulta accesible a través de la Red. Un centro sanitario es también un centro de información que, para realizar adecuadamente su función, requiere acceso a cualquier fuente de datos disponible.
    • Necesidad de FORMACIÓN. La formación continuada es parte del trabajo de un médico. La enseñanza online con tecnología multimedia es una de las vías de formación más extendidas en las ciencias biomédicas. Internet es en la actualidad la mayor biblioteca de temas médicos y relacionados con la salud.
    • Necesidad de COMUNICACIÓN. A todos los niveles: con los pacientes, los colegas, los gestores y la comunidad.
    • Necesidad de PARTICIPACIÓN. La medicina actual implica la participación y la ayuda del paciente en la toma de decisiones clínicas que afectan a su salud, y también de los colectivos de enfermos.

    Pretendemos con esta nota dar a conocer a la sociedad española esta injustificable situación anacrónica y trasladar la petición de un Internet abierto a los responsables de la gestión sanitaria en cualquier nivel de responsabilidad en que se encuentren.

  • La revista Annals of Library and Information Studies ALIS Vol.57(3) [September 2010] publica un número especial como tributo a Eugene Garfield en su 85 cumpleaños.

    Disponible gratuitamente en:
    http://nopr.niscair.res.in/handle/123456789/10230

    Información enviada a MEDLIB por Benoit Thirion

  • Los días 10, 17 y 24 de noviembre se ha programado el Curso “Recursos de información y documentación en ciencias de la salud» (solicitada acreditación), de 12 horas de duración en horario de tarde y dirigido a los profesionales sanitarios del Hospital de Getafe.

    El contenido es el siguiente:

    10 de Noviembre de 2010
    Módulo 1. Introducción a las búsquedas bibliográficas y Biblioteca Virtual Laín Entralgo. 4 horas (Profesor: José Manuel Estrada, Biblioteca de la ALE)

    • ¿Qué es una búsqueda bibliográfica?
    • Cómo desarrollar una estrategia de búsqueda bibliográfica.
    • Búsquedas con términos MeSH.
    • Funciones y servicios de la Biblioteca Virtual.
    • Servicios bibliotecarios (Catálogo de revistas, solicitud de artículos, acceso a recursos electrónicos).
    • Acceso a los recursos disponibles.
    17 de Noviembre de 2010
    Módulo 2. Búsquedas bibliográficas con PubMed/MEDLINE. 4 horas (Profesora: Rosa Trueba, Biblioteca del Hospital Univ Príncipe de Asturias)

    • ¿Conocemos el contenido de este recurso bibliográfico? ¿Cómo accedemos?
    • Tipos de búsquedas: ¿Existe un tipo de búsqueda idónea?.
    • Cómo desarrollar una estrategia de búsqueda bibliográfica. Principales herramientas de optimización de la búsqueda bibliográfica.
    • Visualización y manejo de resultados.
    • Cómo acceder al texto completo cuando hacemos una búsqueda bibliográfica en MEDLINE/PubMed.
    • MyNCBI: guardar y recuperar estrategias, crear alertas, guardar referencias, filtros personalizados y bibliografía personal.
    24 de Noviembre de 2010
    Módulo 3. Recursos de información para la búsqueda de la evidencia científica. 4 horas (Profesora: Concepción Campos, Biblioteca del Hospital Univ de Getafe)

    • Acceso a la información y tipos de fuentes para la toma de decisiones clínicas.
    • Filtros metodológicos para la búsqueda de estudios en bases de datos generales.
    • Búsqueda de revisiones sistemáticas: The Cochrane Library, Biblioteca Cochrane y otros accesos a revisiones.
    • Cómo localizar Guías de Práctica Clínica (GPC).
    • Metabuscadores: TripDatabaseplus y Excelencia Clínica.
    • Otras fuentes de información predigeridas: UpToDate.

    • Más información en la Biblioteca.

  • Leo en el Blog de El Rincón de Sísifo la interesante entrada «(Med Clin) Las revisiones sistemáticas dependen del PRISMA con el que se miren | Sala de lectura» donde se comentan dos artículos de Medicina Clínica:

    Urrútia G, Bonfill X. Declaración PRISMA: una propuesta para mejorar la publicación de revisiones sistemáticas y metaanálisis. Med Clin (Barc). 2010 Oct 9;135(11):507-11. Epub 2010 Mar 5. Spanish. PubMed PMID: 20206945.

    Moher D, Liberati A. Revisiones sistemáticas y metaanálisis: la responsabilidad de los autores, revisores, editores y patrocinadores. Med Clin (Barc). 2010;135(11): 505-506.

    PRISMA es el acrónimo de Preferred Reporting Items of Systematic reviews and Meta-Analyses, evolución del conocido QUORUM (Quality Of Reporting Of Meta-analyses) publicado en 1.999.

    En el primero de los artículos se analizan los cambios más relevantes introducidos en la lista de comprobación PRISMA respecto a QUORUM. Dentro de estos cambios, quiero destacar la de búsqueda de la sección de Métodos que dice: «PRISMA desdobla el ítem sobre la «búsqueda» de QUOROM en 2 ítems: a) fuentes de información (ítem 7) y b) búsqueda (ítem 8). Aunque la estrategia de búsqueda se reporta tanto en QUOROM como en PRISMA, éste solicita a los autores que proporcionen la descripción completa de, al menos, una estrategia de búsqueda electrónica (ítem 8), sin ésta no es posible reproducir la búsqueda.»

    Recordar que PRISMA es un instrumento para mejorar la calidad de las revisiones sistemáticas y meta-análisis existiendo el instrumento Agree para guías de práctica clínica y CONSORT para ensayos clínicos y el PRISMA.

  • Me entero por la entrada del blog Grupo de MBE de la smumfyc: Excelencia Clínica ya no es el «tripdatabase en castellano» que desde el 30 de Junio Excelencia clinica finalizó la relación con TRIPDatabase.

    Excelencia Clínica comenzó en Diciembre de 2008 como un proyecto de colaboración entre TRIP, el Ministerio de Sanidad y el Centro Cochrane Iberoamericano como un motor dse búsqueda bilingue (Español e inglés) tomando como modelo TRIP Database.

  • ¿Es posible mantenernos al día? Esto es lo que se preguntan los autores de este interesante trabajo y la mayoría de los profesionales sanitarios que se encuentran desbordados por la cantidad de información médica que se publica.

    Aquí os dejo el enlace al texto compelto así como algunas de las figuras. De imprescindible lectura (me entero vía #SIETEs7).

    PLoS Medicine: Seventy-Five Trials and Eleven Systematic Reviews a Day: How Will We Ever Keep Up?.



  • El 24 de septiembre se ha actualizado el buscador PSE Publicaciones Secundarias Españolas (y/o en español) que permite rastrear artículos valorados críticamente en revistas secundarias elaboradas en España y Latinoamérica.


    Más información en: Publicaciones secundarias de España y Latinoamérica: actualización del buscador (24 de septiembre de 2010).

  • Leo una interesante y de recomendable lectura entrada en bibliotecarios 2.0: ¿Por qué baja el número de visitas a los catálogos y webs de las bibliotecas? en la que analizan el comportamiento de los usuarios, en este caso estudiantes universitarios, que demuestran su interés y satisfacción con Google, frente a los recursos que puede ofrecer la biblioteca. En esta se dice: «Los estudiantes ven en Google un servicio rápido, disponible universalmente, sin límites de tiempo de conexión, intuitivo, tolerante a los errores o fallos que se comentan, y nuestros sistemas son generalmente toscos y poco amigables, con grados de usabilidad muy pobres. Incluso con los sistemas de descubrimiento de los recursos electrónicos, se quejan de que no tengan un «quiso decir» y de que no ofrezcan en general otras alternativas como ofrece google».

    Leyéndola he recordado otra entrada de Primum non nocere de Rafa Bravo de este mes de septiembre de título «el más rápido en la ciudad de la información médica» en el que comenta los resultados de una artículo publicado en el Postgraduate Medical Journal. Pues bien, me lo ha recordado pues, aplicado a los médicos, llega a unos resultados sorprendentemente similares en cuanto a preferencias relacionadas a Google. Rafa termina con la siguiente afirmación: «el uso de herramientas de búsqueda como Google une a su potencia, la rapidez y facilidad de uso lo que revierte en un ahorro importante de esfuerzos en las búsquedas de información. Se pueden encontrar herramientas de búsqueda y base de datos mejor construidas, más estructuradas, incluso más científicas, pero ¿son tan útiles como Google?».

    Los bibliotecarios y aquellos que trabajamos dando un servicio de acceso a la información no deberíamos de engañarnos y contrariamente de lo que podamos querer pensar darnos cuenta que Google es ampliamente utilizado por los profesionales sanitarios, sobre todos por los llamados Generación Google, para buscar información médica frente a fuentes de información tradicionales. No deberíamos seguir diseñando bibliotecas virtuales y catálogos estupendos desde nuestro punto de vista pero que nuestros usuarios no quieren usar o esforzarse en  aprender a utilizar y fijarnos en lo que la NLM está haciendo con PubMed. Pienso que el uso de Google es imparable e inevitable aunque personalmente me parezca tristemente empobrecedor .

    Como soluciones solo veo diseñar nuestros accesos a los sistemas y productos ‘copiando’ lo mejor que tiene Google (sencillez y rapidez) y dar mucha, muchísima formación a los usuarios pero no la tradicional que solemos dar sino saliendo de las bibliotecas y estando donde el médico se encuentra.

  • El próximo 15 de diciembre se celebrará la III Jornada Científica del Hospital Universitario de Getafe quedando abierto el plazo para la presentación de trabajos y casos clínicos, así como solicitudes para la beca de estancia corta. Fecha máxima de entrega: 31 de octubre 2010.

    Más información en la Intranet.

  • Me entero por el Blog de David Rothman de la existencia de PMinstant inspirado en Google Instant.

  • Del 13 al 15 de octubre se ha programado el Curso “Acceso a los recursos bibliográficos suscritos por el Hospital de Getafe y la BVALE» (solicitada acreditación), de 6 horas de duración y dirigido a los profesionales sanitarios del Hospital Universitario de Getafe.

    El contenido es el siguiente:

    Módulo 1. Acceso a los recursos bibliográficos. 1 hora

    • ¿Conocemos los recursos bibliográficos accesibles para el Hospital Universitario de Getafe?
    • La Intranet como punto de acceso a la información de la Biblioteca.
    • Cómo sabemos si disponemos de acceso electrónico a una revista o en los fondos en papel de la Biblioteca: C17 o Catálogo de revistas de la Biblioteca del Hospital de Getafe.

    Módulo 2. PubMed. 3 horas

    • ¿Conocemos el contenido de este recurso bibliográfico? ¿Cómo accedemos?
    • Cómo desarrollar una estrategia de búsqueda bibliográfica.
    • Principales herramientas de optimización de la búsqueda bibliográfica.
    • Cómo acceder al texto completo cuando hacemos una búsqueda bibliográfica en MEDLINE/PubMed.

    Módulo 3. Portal de la Biblioteca Virtual. 1 hora

    • Cómo obtener el texto completo de un artículo de revista no suscrito. Portal de la Biblioteca Virtual: Servicio de Obtención del Documentos y Banco de documentos digitalizados.

    Módulo 4. Acceso a otros recursos disponibles. 1 hora

    • UpToDate, MD-Consult, EMBASE, Web of Knowledge, Biblioteca Cochrane Plus, RefWorks, etc.

    Más información en la Biblioteca.

  • Para conocer la situación de las distintas convocatorias de personal estatutario sanitario abiertas en Madrid puedes consultar aquí.

  • Tal como ya anunciaba en BiblioGETAFE, se ha modificado la licencia de la FECYT relativa a la Web of Knowledge (WOK).

    Hoy leo la siguiente noticia cuando entro a consultar:

    NOTICE: Your organization does not receive data updates to the following database(s): Index Chemicus (IC); Current Chemical Reactions (CCR-EXPANDED); Engineering Section; Conference Proceedings Citation Index- Social Science & Humanities (CPCI-SSH); Electrical and Electronic Section; Chemical Section; Conference Proceedings Citation Index- Science (CPCI-S).

  • Interesante reflexión Juan Aréchaga sobre el impacto de las revistas científicas españolas.

    Hecho en falta en los motivos de la escasa relevancia que nuestras revistas tienen la mención a los sistemas establecidos de medición de los investigadores, docentes, clínicos,… y de la producción científica de las instituciones que les obligan a pasar por el por todos reconocido como poco adeucado Factor de Impacto.

    Tan solo comentar de la siguiente afirmación: «Mientras, nuestros bibliotecarios e investigadores gastan su hijuela en financiar sociedades y editoriales extranjeras», que desde las bibliotecas hemos hecho enormes esfuerzos para difundir la idea de la poca adecuación de estos sistemas de medición basados en el FI y el poco caso que siempre se nos ha hecho. Y en definitiva, gastamos nuestros presupuestos en adquirir el acceso de aquellos recursos que nuestros usuarios demandan no siendo nuestra misión el mantener vivas revistas sean del país que sean.

    Texto completo en: No importan solo cuántos nos citan, sino quienes y cómo lo hacen · ELPAÍS.com.

  • En el periódico El Mundo de hoy lunes 13 de septiembre de 2010, hablan de nuestros Hospital. El artículo de título «Centímetros de piel para salvar vidas» la Dra. Holguin y el Dr. Casares hablan de la importancia del trasplante de tejidos de piel humana.

    Más información aquí.

  • Se encuentra disponible la monografía: Guía de valoración de incapacidad laboral para Atención Primaria.

    Editada por la Escuela Nacional de Medicina del Trabajo del ISCIII.


    Puede acceder a ella por el siguiente enlace aquí

  • La FECYT informa que, tras un exhaustivo análisis de utilización de las bases de datos,  a partir del próximo mes de agosto se van a producir importantes novedades en el acceso a la Web of Knowledge.

    Con la nueva licencia (2010 a 2013) se va a restringir el número de productos a los que se tendrá acceso. Continuarán disponibles la Web of Science, Journal Citation Report, Essential Science Indicators, el gestor de referencias EndNote Web y la herramienta Researcher ID. Por el contrario dejaran de estar disponibles el Current Contents, ISI Proceedings, Derwent Innovation Index y MEDLINE.

    Las BBDD de Current Content Connect, Derwent Innovation Index, Medline, los índice químicos Index Chemicus, Current Chemical e ISI Proceedings, estarán disponibles hasta el 15 de septiembre en la plataforma online.

    Más información aquí.

  • A mediados del mes de Agosto daba cuenta de los cambios en las plataformas de Wiley Interscience, ahora Wiley online Library, y de Springer.

    Hoy toca el turno a la plataforma ScienceDirect, ahora llamada SciVerse y que integra tanto a ScienceDirect como Scopus.

    La principal novedad es SciVerse Hub (en beta) con el que podemos buscar en ScienceDirect, Scopus y Scirus.

    El resultado de la búsqueda se muestra en orden de relevancia y sin duplicidades.

    Más información en Electroblog y Biblioteca Médic aVirtual.

  • BEDCA, la Base de Datos Española de Composición de Alimentos, ha sido publicada por la Red BEDCA del Ministerio de Ciencia e Innovación y bajo la coordinación y financiación de la Agencia Española de Seguridad Alimentaria y Nutrición del Ministerio de Sanidad y Política Social.

    En ella podemos consultar las características de ingredientes y platos comunes en la dieta española. Los valores de composición de alimentos recogidos en esta base de datos han sido obtenidos de distintas fuentes que incluyen laboratorios, industria alimentaria y publicaciones científicas o calculados. De momento, hay 500 productos en el sistema, pero se espera que para finales deaño se haya llegado al millar.

    La información disponible incluye composición (grasas, tipos de ellas, sal) y propiedades energéticas (calorías), entre otros datos (hay 39 cuantificados).

    Más información aquí.

  • En la entrada anterior de BiblioGETAFE daba cuenta de una nueva revista del grupo BMJ llamada «BMJ Open» y me ha hecho recordar la existencia de la revista BMJ Case Report.

    BMJ Case Report comenzaba en noviembre de 2008 con el objetivo de permitir a los médicos  compartir sus experiencias y aprender de los demás. Se trata, en definitiva, de un repositorio de casos clínicos.

    Tiene como novedad que para poder acceder a su contenido (lector) así como para poder enviar casos clínicos (autor) hay que ser Fellow y pagar la suscripción anual.  Este modelo dió muchos quebraderos de cabeza a una compañera bibliotecaria a la que una usuaria le solicitó un artículo del que era autora y, además, cotejado/compulsado. Se encontró con que ninguna Biblioteca podía suministrarle el contenido. Al final todo se resolvió cuando su usuaria recordó que disponía de clave de acceso, requisito para ser autora.

  • En la lista de bibliotecas médicas americanas MEDLIB-L he leído que se ha producido un equívoco con la revista British Medical Journal.

    Al parecer, algunos bibliotecarios habían anunciado que la revista BMJ se dejaba de acceso libre. Al final, no se ha puesto en abierto el BMJ si no que lo que ha comenzado es una nueva revista llamda «BMJ Open» que estará disponible en otoño de este año.

    Más información en: BMJ Group blogs: BMJ Open » Blog Archive » BMJ Open: accessible medical research.

  • Springer ha cambiado la plataforma a la nueva SpringerLink en el mes de julio de 2010.

    El métodos de autenticación con el nombre de usuario y contraseña sigue trabajando sin cambios. El enlace también sigue siendo el mismo http://www.springerlink.com/.

  • Wiley ha lanzado una nueva plataforma llamada «Wiley Online Library». Esta ha reemplazado completamente a Wiley InterScience pero no ha modificado las claves de acceso que teníamos y que siguen siendo válidas.

    Lo que si ha mejorado es el acceso a «institutional login» que es donde hay que ir a introducir la clave y contraseña y que hasta ahora generaba muchos problemas. Este se encuentra siempre disponible en la parte superior de la pantalla. De esta forma, cuando enlazamos desde PubMed el acceso se encuentra disponible desde el mismo artículo y no es necesario volver hacia la página de inicio para buscar este enlace para poder teclear la clave institucional.