Acaba de anunciar la NLM que en breve cambiará el nombre para la función de MyNCBI de crear alertas por correo electrónico pasando de «Save Search» a «Create Alert». También se renombrará el enlace «RSS» a «Create RSS».
Más información aquí.
Categoría: Bases de datos
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Para evitar confusiones y evitar ambigüedades, «Related citations» pasará a llamarse «Similar Articles» como vemos en la imagen.
Mediante este enlace se recupera un conjunto precalculado de citas en PubMed que están estrechamente relacionados con el artículo seleccionado. Los artículos similares se mostrarán en orden de puntuación de mayor a menor relevancia. El algoritmo para generar los resultados no se ha modificado. Así, el conjunto de artículos similares se genera mediante la comparación de palabras del título, resumen y términos MeSH usando un algoritmo (ver más información aquí).
Más información aquí.
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Las bases de datos como PubMed/MEDLINE y otros recursos de la National Library of Medicine son herramientas de uso diario para los especialistas en información de ciencias de la salud por lo que es fundamental mantenernos al día de las últimas novedades y más teniendo en cuenta que están en continuo cambio.
La NLM incorporó desde un principio todas las herramientas que nos ofrecen estas redes sociales, blogs, listas,… para informar, difundir contenidos y estar en contacto con todos sus usuarios. Es posible conectarse via Facebook, Twitter, Pinteres, suscribirse a canales de YouTube y Slideshare, suscribirse vía RSS a noticias, podscats y webcats, y a listas de distribución a través de correo-e. Aquí tenéis la lista completa para conectaros a la NLM y la página oficial de RSS Feeds.
Personalmente os recomiendo la suscripción al NLM Technical Bulletin pues es la fuente para la información más reciente.
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Acaba de publicar la revista JAMA (Rethlefsen ML, Murad MH, Livingston EH. Engaging medical librarians to improve the quality of review articles. JAMA. 2014 Sep 10;312(10):999-1000. doi: 10.1001/jama.2014.9263. PubMed PMID: 25203078.) un interesante artículo en el que recomienda la colaboración de los bibliotecarios médicos en los artículos de revisión.
Esta colaboración queda reflejada en el siguiente cuadro:
Además, recomienda que cuando se está preparando un manuscrito para su publicación, el bibliotecario debe escribir la metodología y los resultados de la búsqueda. La información básica relativa a la metodología de búsqueda debe incluirse en el manuscrito principal, mientras que la estrategia de búsqueda completa debe estar en un documento complementario. El manuscrito principal debe incluir las bases de datos y plataformas utilizados, la cobertura temporal de la búsqueda, la fecha en que la búsqueda se realizó en primer lugar, los límites o filtros de búsqueda utilizados en la estrategia de búsqueda, los métodos de actualización y las fechas realizadas asó como los calificadores del buscador. También debe indicarse si la estrategia ha tenido peer-review por otro bibliotecario. Así mismo se debe especificar si no se utilizaron límites de búsqueda.
Los bibliotecarios que ayudan en el proceso de revisión deben redactar la parte de la sección de resultados de un manuscrito que se refiere a los resultados de búsqueda. Los resultados deben incluir el número total de documentos que se encuentran antes y después de la eliminación de duplicados y el número de materiales eliminados en cada etapa del proceso de revisión. Deben incluirse diagramas de flujo que representen los materiales encontrados, incluidos o excluidos en el manuscrito.
El artículo concluye afirmando que los bibliotecarios médicos juegan un papel central en la asistencia a los médicos para acceder a la literatura médica necesaria para proporcionar cuidados a los pacientes. También pueden desempeñar un papel importante en el desarrollo de la redacción de alta calidad y revisiones sistemáticas, la construcción de estrategias de búsqueda, gestión de referencias, la revisión de las referencias para la inclusión, la documentación de la metodología de búsqueda y la contribución a la redacción del manuscrito final. Tener un bibliotecario médico estrechamente implicado asegura que la revisión sea exhaustiva y su metodología reproducible. Los bibliotecarios médicos aportarán su experiencia al proceso de revisión basado en su comprensión de la literatura médica, los métodos de búsqueda y las directrices y los criterios de revisión. Su neutralidad y experiencia pueden ayudar a minimizar el sesgo en el proceso de revisión, lo que lleva a artículos de revisión más robustos e imparciales.
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La consulta de EMBASE no requiere clave ni contraseña si se accede desde la red de las instituciones sanitarias de la Comunidad de Madrid. Si desea el acceso remoto desde cualquier ordenador externo a la red sanitaria es necesario seguir los siguientes pasos:
- Desde un ordenador de la red sanitaria ir a la página web de Embase http://www.embase.com
- Pinchar en el botón de «Login» (parte superior derecha de la pantalla).
- Pinchar en «Click here to activate» en el apartado de «Remote acces activation».
- Debe introducir un correo electrónico con el domino salud.madrid.org
- En el la dirección de correo que haya facilitado recibirá un correo con un enlace de activación. Tendrá que ser activado lo antes posible desde la organización en la que trabaje (ordenador dentro de la red sanitaria institucional).
- Al pinchar sobre el enlace, es posible que el sistema le solicite seleccionar una institución. Elija la más apropiada.
- Una vez realizado este paso, aparecerá un mensaje indicando que el acceso remoto ha sido activado correctamente: «Your email address has been successfully verified for remote access activation».
- Con el nombre de usuario y contraseña que haya elegido, compruebe desde la red institucional que el acceso remoto está correctamente activado. Después, se podrá acceder desde cualquier lugar.
Aquí os dejo una presentación de los pasos a seguir:
Más información en Portal de la Biblioteca Virtual.
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Hay veces que nuestros usuarios nos demandan información sobre ensayos clínicos en curso. Hay varias web que registran dichos ensayos clínicos siendo las más conocidas las siguientes:
ClinicalTrials.gov es un recurso basado en la Web que ofrece a los pacientes, sus familiares, profesionales sanitarios, investigadores y el público, fácil acceso a la información sobre estudios clínicos con apoyo público y privado en una amplia gama de enfermedades y condiciones. El sitio web es mantenido por la Biblioteca Nacional de Estados Unidos de Medicina (NLM). La información es actualizado por el promotor o el investigador principal del estudio clínico. Generalmente los estudios se presentan y registran cuando comienzan y la información en el sitio se actualiza durante todo el estudio. En algunos casos, los resultados del estudio se presentaron después de que termine el estudio.
Cada registro ClinicalTrials.gov incluye lo siguiente:
Enfermedad o condición
Intervención (por ejemplo, el producto médico, la conducta o procedimiento en estudio)
Título, descripción y diseño del estudio
Los requisitos para participar (criterios de elegibilidad)
Lugares en los que se realizó el estudio
Información de contacto
Enlaces a información relevante sobre otros sitios web de salud, tales como la NLM MedlinePlus ® para obtener información de salud del paciente y en PubMed ® para citas y resúmenes de artículos.Algunos registros incluyen también información sobre los resultados del estudio, tales como: Descripción de los participantes en el estudio (el número inicial y al completar el estudio y sus datos demográficos); Resultados del estudio; y resumen de efectos adversos experimentados por los participantes en el estudio.
Plataforma de registros internacionales de ensayos clínicos de la OMS (ICTRP) es un conjunto de datos consensuados internacionalmente sobre el diseño, la conducción y la administración de ensayos clínicos. Esta información se publica en un sitio web de acceso público administrado por un registro que cumple con los estándares de la OMS. El objetivo principal de la ICTRP de la OMS es posibilitar el registro prospectivo (es decir, antes de que se reclute al primer participante) de todos los ensayos clínicos que esté al alcance del público.
EU Clinical Trials Register permite buscar por el protocolo y la información sobre resultados de ensayos clínicos que se llevan a cabo en la Unión Europea (UE), el Espacio Económico Europeo (EEE) y los ensayos clínicos que se realizan fuera de la UE / EEE si forman parte del Paediatric Investigation Plan (PIP). En la actualidad hay registrados 22.832 ensayos clínicos de los cuales 3.010 son ensayos clínicos llevados a cabo con sujetos de menos de 18 años de edad.
REec o Registro español de ensayos clínicos que proporciona información a pacientes y profesionales de la salud sobre investigaciones clínicas permitidas en España para informarles sobre los estudios que se están realizando en relación a su enfermedad o con uno o varios medicamentos determinados. Se registran todos los ensayos clínicos autorizados en España desde enero de 2013, todos los estudios observacionales autorizados y otros estudios registrables con carácter voluntario que al menos tengan dictamen favorable de un Comité de ética de la Investigación.
Registro de ensayos clínicos
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Como explicaba mi compañero Juan Medino en su Blog Biblioteca HFLR las revistas de la editorial Elsevier están disponibles en las plataformas ScienceDirect y ClinicalKey. A Ambas plataformas tenemos acceso a través de la BV de la Consejería de Sanidad.
«Para evitar duplicidades de revistas, la BV no ha renovado los títulos de Science
Direct que estaban en ClinicalKey, esta es la razón por la que estáis viendo que de determinadas revistas no están disponibles los números de 2014: solución, acceded a través de Clinical Key.En ScienceDirect tendremos el retrospectivo desde 1999 más o menos en la mayoría de revistas y en cambio en Clinical Key lo más reciente.»También tenéis que tenerlo en cuenta cuando hagáis una búsqueda bibliográfica en la base de datos EMBASE. Cuando desde un registro se una referencia hacemos clic en el enlace «Go to publisher for the full text», se abre el artículo en ScienceDirect donde no está disponible si es del año 2014 y nos pide que lo compremos. Sin embargo, el artículo si se encuentra disponible en la plataforma ClinicalKey.
Hemos enviado una incidencia para que EMBASE incluya el enlace a ClinicalKey o ver la posibiblidad de configurar EMBASE para que, por defecto, en vez de ScienceDirect se abra ClinicalKey.
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Cuando un registro se añade a PubMed, se le asigna un número único, el PMID o PubMed Identifier. Por lo tanto, nunca encontraremos dos referencias con el mismo PMID. Actualmente está formado por un número de 8 dígitos (P. ej.: 24450889) que la base de datos requiere para almacenar, buscar y recuperar información.
Cada número que introducimos en la ventana de búsqueda en PubMed es tratado por defecto como si fuera un PMID. Por esta razón no podemos escribir “2014” en la ventana de búsqueda para localizar artículos del año 2014 pues el resultado sería el artículo de PMID 2014 (que corresponde a un artículo del año 1975). La búsqueda en este caso sería «2014[dp]».
En el siguiente vídeo os detallo dos de las principales utilidades de este número: solicitar un artículo por el Portal de la Biblioteca Virtual y crear un hipernelace a un artículo específico y añadir, por ejemplo, en nuestro curriculum vitae.
PMID: Qué es y utilidad
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MeSH es el acrónimo de Medical Subject Headings y es el vocabulario controlado de términos biomédicos que representan el contenido de cada artículo que se ingresa en la base de datos MEDLINE. Hay aproximadamente 26.000 términos médicos que se encuentra organizados alfabéticamente y de manera jerárquica.
Los indizadores de MEDLINE de la NLM examinan los artículos y asignan los encabezamientos MeSH apropiados más específicos que describan los conceptos principales que se tratan en el artículo. El indizador asigna tantos encabezamientos como sean apropiados para cubrir los temas del artículo: generalmente de 5 a 15.
El término MeSH que refleja los puntos principales o Major MeSH de un artículo es señalado con un asterisco (*) por los indizadores.
Además, podemos cualificar las búsquedas por MeSH utilizando los subencabezamientos o subheadings particulares de un encabezamiento MeSH. En total hay 83 subheadings organizados por categorías (Administration & dosage, Adverse effects, Complications, Diagnosis, Drug therapy, Epidemiology, Organization & administration, Pharmacokinetics, Prevention & control, Surgery, Therapeutic use).Si quieres aprender cómo construir y centrar una búsqueda en PubMed utilizando la base de datos MeSH aquí tienes un vídeo de la NLM:
Por último hay que recordar que realizar búsquedas mediante la opción MeSH Database es sólo una de las múltiples formas de buscar en PubMed y que deberemos tener en cuenta que si buscamos por MeSH la búsqueda es más precisa pero se pierde todas aquellas referencias más recientes no incorporadas a MEDLINE.
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Se han publicado las estadísticas de MEDLINE y ya sabemos que hay 20.695.240 referencias en la base de datos, 734.052 de las cuales se han introducido en el año fical de 2013.
Más información en: http://www.nlm.nih.gov/bsd/pmresources.html#statistics
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PubMed ha incorporado una nueva opción de filtrar los resultados por aquellos artículos que han recibido comentario a través del nuevo sistema PubMed Commons. Para ello hacemos una búsqueda y en la columna de la izquierda vemos la opción «PubMed Commons: Reader comments».
![FireShot Screen Capture #742 - 'A 4-month-old boy with acrodermatitis enteropa___ [Eur J Pediatr_ 2009] - PubMed - NCBI' - www_ncbi_nlm_nih_gov_pubmed__term=cystic+fibrosi](https://bibliogetafe.com/wp-content/uploads/2014/01/fireshot-screen-capture-742-a-4-month-old-boy-with-acrodermatitis-enteropa___-eur-j-pediatr_-2009-pubmed-ncbi-www_ncbi_nlm_nih_gov_pubmed__termcysticfibrosi.jpg?w=468&h=345)
Además, hoy anuncian que PubMed Commons ha establecido la funcionalidad de clasificación mediante el «you found this useful» en los comentarios.
Los autores de PubMed que se han unido en PubMed Commons pueden hacer clic en «sí» o «no» a la pregunta: «Was this helpful?»
Entre las clasificaciones que ya se están recibiendo están las que la gente no encuentra útil como la clase de comentario que elogia un artículo sin decir por qué o la que sólo está comunicando algo que ya está claro en el resumen. Así mismo hacer un comentario similar en repetidas ocasiones también tiende a ser impopular, ya que es autopromoción.
Por el momento el comentario más popular es el de Gonzalo Otazu en diciembre. Otazu pone en duda la validez de las estadísticas en un artículo que ha recibido un montón de atención de los medios: un estudio que sugiere que los ratones pueden heredar el miedo de los olores asociados con traumas de sus padres.
![FireShot Screen Capture #743 - 'Parental olfactory experience influences behavi___ [Nat Neurosci_ 2014] - PubMed - NCBI' - www_ncbi_nlm_nih_gov_pubmed_24292232_report=abst](https://bibliogetafe.com/wp-content/uploads/2014/01/fireshot-screen-capture-743-parental-olfactory-experience-influences-behavi___-nat-neurosci_-2014-pubmed-ncbi-www_ncbi_nlm_nih_gov_pubmed_24292232_reportabst.jpg?w=468&h=314)
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Recientemente PubMed incluye las afiliaciones de todos los autores, autores corporativos y colaboradores siempre que los datos sean suministrados por los editores.
Para ver la información de afiliación, hay que seleccionar el formato de visualización «abstract» y luego hacer clic en «Author Information». Si hay más de un autor se asocia cada uno con su afiliación mediante un número en superíndice y en diferentes líneas, tal como vemos en el siguiente ejemplo:
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A partir de ahora todos los usuarios de la Biblioteca podéis acceder a la nueva plataforma de referencia clínica ClinicalKey www.clinicalkey.com
ClinicaKey es la nueva herramienta creada por Elsevier que sustituye a MDConsult a partir del 1 de enero de 2014.
ClinicalKey incluye contenido de 37 especialidades médico-quirúrgicas con:
· + de 550 revistas incluidas las Clínicas de Norteamérica de las diferentes especialidades
· + de 1.150 libros
· + de 4.900 Guías clínicas
· + de 9.200 fichas para pacientes
· + de 2.900 medicamentos
· + de 2.400.000 de material de multimedia…
Te invitamos a que pruebes desde ahora la herramienta y a que acudas a la Biblioteca para solicitar información adicional. El acceso es vía IP sanitaria.
Nuevo recurso ClinicalKey
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A PubMed podemos entrar de tres formas diferentes:
- URL genérica de PubMed (www.pubmed.com; http://www.pubmed.gov; http://www.pubmed.org;…)
- URL de nuestra institución, que para el Hospital Universitario de Getafe es www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?myncbishare=bibgetafe
- Crearnos nuestra propia cuenta en MyNCBI
Las ventajas de tener una cuenta personal en PubMed son:
- Podemos salvar estrategias (“Saved Search”)
- Podemos guardar resultados (“Collections”)
- Crearnos nuestra bibliografía (“My Bibliography”)
- Recibir alertas bibliográficas en nuestro correo
- Configurar nuestras preferencias (“NCBI Site Preferences” como cambiar el correo, resaltar los términos de búsqueda, modificar el formato de visualización de los resultados,…)
- Crear nuestros filtros para los resultados (“Filters”)
- Añadir un icono de acceso al texto completo (“LinkOut”)
- Gestionar nuestra actividad reciente (“Recent Activity”)
En la siguiente presentación encontraréis los pasos a seguir para crearos vuestra propia cuenta en PubMed:Si os creáis una cuenta en PubMed seguro que os interesa una entrada anterior de BiblioGETAFE en la que se enseñaba como crear alertas de revistas para recibirlas en nuestro correo electrónico. -
MedTerm Search Assist es una herramienta creada por la Health Sciences Library System de la Universidad de Pittsburg de ayuda de búsqueda para la base de datos MEDLINE. Este asistente está desarrollado por y para bibliotecarios para que mediante esta se comparta palabras clave, estrategias y consejos de búsqueda con los demás.
Está todavía en crecimiento y necesita la ayuda de cualquier bibliotecario que quiera agregar nuevos términos en la base de datos o sugerir nueva información que añadir a los registros ya existentes. Cada registro contiene el término de entrada y variantes de palabras clave. Hay campos opcionales como el MeSH, acción farmacológica, subencabezamientos flotantes, nombres de sustancias, estrategia de búsqueda en PubMed y en el MEDLINE de OVID.
Para localizar un término dentro de la base de datos usar la pestaña por defecto «Find a Term».
También podemos navegar por el listado alfabético de términos si entramos en el enlace «browse».
Si, por ejemplo, buscamos por el término «osteoarthritis» el resultado es el siguiente registro:
Podemos añadir términos a la base de datos. Para ello debemos entrar en «Add a Term» y completar un formulario de inscripción. También se puede también contribuir añadiendo a un registro ya existente palabras clave adicionales, estrategias de búsqueda o consejos de búsqueda.
Si queremos añadir más información al registro de «osteoarthritis» pinchamos en el enlace «Add additional keywords, subject terms, or search strategies» y la nueva página nos ofrece esta posibilidad.
![FireShot Screen Capture #742 - 'A 4-month-old boy with acrodermatitis enteropa___ [Eur J Pediatr_ 2009] - PubMed - NCBI' - www_ncbi_nlm_nih_gov_pubmed__term=cystic+fibrosi](https://bibliogetafe.com/wp-content/uploads/2014/01/fireshot-screen-capture-742-a-4-month-old-boy-with-acrodermatitis-enteropa___-eur-j-pediatr_-2009-pubmed-ncbi-www_ncbi_nlm_nih_gov_pubmed__termcysticfibrosi.jpg)
![FireShot Screen Capture #743 - 'Parental olfactory experience influences behavi___ [Nat Neurosci_ 2014] - PubMed - NCBI' - www_ncbi_nlm_nih_gov_pubmed_24292232_report=abst](https://bibliogetafe.com/wp-content/uploads/2014/01/fireshot-screen-capture-743-parental-olfactory-experience-influences-behavi___-nat-neurosci_-2014-pubmed-ncbi-www_ncbi_nlm_nih_gov_pubmed_24292232_reportabst.jpg)
biblioGETAFE 